Parte dos testes de emissões em todos os carros é verificar se há vazamentos de vapor de combustível. Existem muitas maneiras de fazer isso, uma delas é selar o sistema e executar uma pequena bomba de vácuo e, em seguida, usar um sensor de pressão para testar vazamentos. Isso tem que ser feito muito depois que o carro é desligado e totalmente resfriado, caso contrário, as mudanças naturais de pressão no tanque de combustível causarão leituras falsas. É muito provável que você tenha estado em um lugar tranquilo quando tal teste ocorreu e ouviu a bomba na parte traseira do carro que é usada para o teste. Terei que investigar isso mais a fundo, mas essa é uma causa muito comum desse ruído inexplicável nessa área.
Não se preocupe, não há nada de errado. Até minha motocicleta faz testes de emissões depois que eu a desligo. É estranho ouvi-lo pela primeira vez, zumbidos, cliques e ruídos do nada...